Voyages extraordinaires dans les sciences

Ces questions intéressent tout le monde et elles sont posées aujourd’hui à Marc Cuggia, professeur à l’université de Rennes et praticien hospitalier au CHU Pontchaillou à Rennes. Chercheur au laboratoire Traitement du signal et de l’Image, unité Inserm U1099, sa discipline, l’informatique médicale, est peu connue du grand public. Elle joue pourtant un rôle majeur dans l’ensemble de notre dispositif de santé. Cet entretien, réalisé dans le cadre de l’émission « Voyages extraordinaires dans le monde des sciences » sur Radio Laser en partenariat avec Unidivers, va permettre d’y répondre.

Information médicale, données patients, dossier médical… Que recouvrent tous ces termes ? Eh bien, tout ce qui concerne notre santé : résultats d’examens cliniques et biologiques, diagnostic, imagerie, traitements médicamenteux… Qui les étudie et comment ? C’est là que l’informatique médicale intervient. Elle ne s’occupe pas, en effet, des installations informatiques comme nous pourrions le croire mais des recueils de symptômes, des mesures faites aussi bien par les médecins de ville, généralistes et spécialistes, que dans les hôpitaux et les cliniques. Elle croise donc toutes les disciplines médicales. Par exemple, pour l’étude épidémiologique en population, essentielle pour la recherche sur les maladies rares. Les données sont une chose, mais il s’agit tout autant de l’intégration des connaissances, de leur modélisation, et de leur exploitation.
Données massives (plus connues sous le mot de « big data ») collectées dans les entrepôts de données de santé et les plateformes, e-santé, télémédecine, etc. des évolutions majeures ont vu le jour ces dernières années. Marc Cuggia nous explique comment elles sont mises en œuvre, quels en sont les enjeux en termes de soins et de santé publique. Et les risques : en particulier par les attaques contre les infrastructures dont les hôpitaux ont pu être et seront encore l’objet. Nous rencontrons là les grands débats sociétaux autour de la cybersécurité, le stockage dans les « data centers » et les objectifs de souveraineté nationale et européenne. Il en va de même avec l’intelligence artificielle qui va impacter la pratique médicale y compris la formation des jeunes médecins.
Au-delà des grands enjeux décrits par Marc Cuggia pour demain, cet entretien est aussi l’occasion de refaire l’histoire de cette jeune discipline dont la figure centrale et visionnaire a été François Grémy en France et en Europe. Ce sont ensuite souvent ses élèves qui ont essaimé partout dans notre pays et ouvert de multiples voies de recherche rejoignant celles conduites en ingénierie biomédicale (des systèmes dits « expert » à la robotique médicale). C’est enfin l’opportunité de rendre hommage aux pionniers dont fait partie Pierre Le Beux à Rennes, disparu trop tôt et dont Marc Cuggia a été l’élève.
Pierre Le Beux, ingénieur centralien et médecin, est une figure majeure de la discipline. Humaniste et visionnaire, il a été à l'origine de nombreux projets pionniers : la formation des médecins par les technologies du web et la simulation, le développement de systèmes d'aide au diagnostic rendant les connaissances médicales accessibles à distance, sur les réseaux, bien avant l'ère d'Internet. Ses contributions les plus originales, qui font aujourd'hui consensus dans la discipline, se déclinent en trois volets. Il a d'abord créé, à Rennes, les tout premiers enseignements universitaires d'informatique médicale en France, formant plusieurs générations de chercheurs et de praticiens. Il a ensuite conçu l'ADM (Aide au Diagnostic Médical), diffusé sur Minitel : bien avant Internet, un médecin pouvait déjà, depuis son cabinet, consulter à distance une base rassemblant plus de 10 000 maladies. Ce fut l'un des tout premiers services de ce type au monde. Il a enfin été un pionnier d'un travail plus discret mais tout aussi essentiel : la mise au point de vocabulaires médicaux communs destinés aux systèmes informatiques en santé, pour qu'un même terme désigne bien la même chose d'un hôpital à l'autre, un travail de fond qui permet aujourd'hui de partager et de réutiliser les données de santé.
Jean Louis Coatrieux
Pour en savoir plus
Association française d'Informatique Médicale : https://www.france-aim.org/page/79803-l-aim
Société française du génie biologique et médical : https://www.sfgbm.fr/
Alain Venot, Anita Burgun, Catherine Quantin, Informatique Médicale, e-Santé – Fondements et applications, éditions Springer, 525 pages, 2013.

Qui aurait pu penser avec l’arrivée à domicile des premières chaînes de télévision dans les
années soixante que nous aurions un peu plus d’un demi-siècle après des murs d’images
tout autour de nous, à portée de main et à longueur de journées ? Panneaux d’affichage,
appareils photo et caméras vidéos numériques, tablettes et téléphones… ces images sont
notre quotidien du matin au soir, occupent tout notre espace de vie. Et nous en
redemandons toujours plus !
Une révolution que nous revisitons avec Patrick Bouthemy, directeur de recherche émérite à
l’Inria, un pionnier du domaine. Que d’obstacles ont été franchis entre ces premiers temps
où les capacités de numérisation, de stockage, de traitement étaient encore dérisoires !
Quand nous parlons aujourd’hui de captures à 1000 images par seconde voire plus, de
téraoctets en volumes de données sur des supports toujours plus miniaturisés. L’image
satellitaire, à elle seule, recouvre l’observation de la terre (sols, milieux urbains,
cartographie), la météorologie, l’océanographie, l’observation militaire. L’image optique
dans le spectre visible à laquelle nous avons accès sur nos appareils personnels est un
élément clé pour la cartographie, la conduite automobile autonome, les visioconférences, la
robotique, etc.L’imagerie médicale s’est développée des ultrasons aux scanners X, de l’IRM
(Imagerie par Résonance Magnétique) à la TEP (Tomographie à Emission de Positons) et en
biologie avec la microscopie par fluorescence et ses multiples variantes ... Séquences
d’images 2D et 3D, séquence d’images en haute résolution… Une multitude de domaines
que nous explorons avec Patrick ont été ainsi de plus en plus concernés et ils vont de
l’infiniment petit à l’infiniment grand et lointain (via les télescopes spatiaux comme Hubble
et récemment James Webb).
Mais que faisons-nous de toutes ces données ? Du visionnage simplement ? C’est là que
nous découvrons le volet incroyablement riche des recherches en « traitement et analyse
d’images », un terme remplacé aujourd’hui par « vision par ordinateur » dont le but est
d’extraire l’information pertinente contenue dans les images. Détection et suivi du
mouvement dans les vidéos, segmentation-extraction des objets d’intérêt et leur
reconnaissance, interprétation des contenus et définition éventuelle d’actions (par exemple,
thérapie en imagerie médicale). Et, de manière complémentaire, indexation et recherche par
le contenu dans les bases de données.

Cette aventure de l’image, Patrick Bouthemy nous la raconte. Il en a été l’acteur de terrain
comme de pilotage (en tant que chercheur et aussi directeur du laboratoire d’excellence
CominLabs en Bretagne et dans d’autres responsabilités).
Mais, me direz-vous, si tout cela a été accompli, qu’avons-nous à attendre de demain ? C’est
tout l’enjeu derrière l’intelligence artificielle, nous dit-il, et face à cet enjeu de nouvelles
recherches sont entreprises qu’il vous raconte aussi. L’engagement des jeunes, filles et
garçons, vers les métiers à venir et où les sciences humaines et sociales y joueront un rôle
essentiel !
Jean Louis Coatrieux

Pour continuer….

https://www.inria.fr/fr
https://cominlabs.inria.fr/
https://interstices.info/histoire-du-traitement-dimages/
https://interstices.info/une-breve-histoire-du-traitement-dimage/
Le Deep Learning pour le traitement d’images (Classification, détection et segmentation avec
Python et TensorFlow), Daphné WALLACH, Editions ENI.

Cette nouvelle émission Radio Laser, Voyages extraordinaires dans le Monde des sciences, menée en partenariat avec la plate-forme culturelle Unidivers, est consacrée à un sujet qui fait aujourd’hui l’actualité. Elle était programmée de longue date et tombe donc à-propos pour tenter de dépasser les mouvements de protestations comme de colères et débattre ensemble de l’avenir. Jean Louis Peyraud était l’interlocuteur idéal pour nous aider à comprendre la situation dans laquelle nous nous trouvons et tenter de répondre aux défis futurs.
Ingénieur Agronome de l’ENSA de Rennes (aujourd’hui Agrocampus Ouest) dans la spécialité Productions Animales, Docteur en Agronomie de l’ENSA de Rennes, directeur de recherches INRAe (Institut National de Recherche en Agronomie et environnement), il a assumé de nombreuses responsabilités au niveau national (chargé de Mission auprès du Directeur Scientifique Agriculture de l’INRAe, Président du GIS « Elevages demain ») et européen, par exemple comme Président de l’Animal Task Force qui réunit une vingtaine de pays européens (@http://www.animaltaskforce.eu/).
L’émission s’est déroulée en deux temps. Tous les sujets brûlants du moment (ou presque tous, tant le domaine est vaste) ont été abordés puis sa vision pour l’avenir a été développée. Ainsi dans la première partie, les fragilités liées aux épizooties (entre animaux) et aux zoonoses (transmissibles à l’humain), la réalité des revenus agricoles en élevage (porcs, volailles, lait, bovins…) et leurs incertitudes, la circulation des animaux aux différentes phases de l’élevage, l’élevage intensif, les questions du vieillissement et des arrêts d’activité, les conséquences de l’abandon de terres cultivables, la fragmentation des syndicats et ses conséquences, les gaz à effet de serre et, bien sûr, l’impact d’accords comme le Mercosur.
En second lieu, Jean Louis Peyraud a développé sa vision d’avenir en dégageant quelques voies de progrès. Nous avons ainsi pu traiter d’approches d’élevage responsable, d’agro-écologie, de circularité au niveau local comme au niveau des territoires, de bien-être animal, des avancées en génétique animale, etc. mais aussi mieux comprendre la signification et les conséquences de slogans comme « souveraineté alimentaire ». Pour éviter les soubresauts permanents que nous connaissons, il appelle à un pacte social associant agriculteurs et éleveurs, syndicats, industriels, distributeurs, consommateurs et pouvoirs publics avec un objectif essentiel pour demain, la réponse à cette question :
Quels compromis sommes-nous prêts à faire en tant que citoyens pour disposer d’une agriculture et d’un élevage pérennes et de qualité capables d’assurer aux producteurs les moyens de vivre décemment et d’assurer notre alimentation de manière durable ?
Jean Louis Coatrieux
Et pour prolonger cette émission, quelques références :
Chapitres d’ouvrages
Dans l’élevage pour l’Agroécologie et une alimentation durable. Editions France Agricole, 320 p 2020. Edts S. Chriki, M.P. Ellies-Oury, J..F Hocquette
Dans quelle politique agricole commune demain ? Versailles, Edition Quae. Détand-Dessendre C., Guyomard H (coord).

Rapports
Peyraud J.L (coordinateur)., Cellier P., Aarts F., Béline F., Bockstaller C., Bourblanc M., Delaby L., Donnars C., Dourmad J.Y., Dupraz P., Durand P., Faverdin P., Fiorelli J.L., Gaigné C., Kuikman K., Langlais A., Le Goffe P., Lescoat P., Morvan T., Nicourt C., Parnaudeau V., Réchauchère O., Rochette P., Vertes V., Veysset P., 2012. Les flux d’azote liés aux élevages : Réduire les pertes, rétablir les équilibres. Expertise scientifique collective, rapport INRA (France), 527 pages, @https://www.inrae.fr/sites/default/files/pdf/3a0ea7ccd43b9e4c291d822bcb5e2e7d.pdf
Peyraud J.L. (Coordinateur), Aubin J., Barbier M., Baumont R., Berri C., Bidanel J.P., Citti Ch., Cotinot C., Ducrot C., Dupraz P., Faverdin P., Friggens N., Houot S., Nozières-Petit M.O., Rogel-Gaillard C., Santé-Lhoutellier V., 2019. Réflexion Prospective interdisciplinaire “Science pour les élevages de demain”. Rapport de synthèse. 53 pp. https://hal.inrae.fr/hal-02899978
Peyraud J.L., Aubin J., Barbier M., Baumont R., Berri C., Bidanel J.-P., Citti C., Cotinot C., Ducrot C., Dupraz0 P., Faverdin P., Friggens N., Houot S, Nozières-Petit M.-O., Rogel-Gaillard C., Santé-Lhoutellier V., 2019. Quelle science pour les élevages de demain ? Une réflexion prospective conduite à l’INRA. In : Numéro spécial, De grands défis et des solutions pour un élevage durable. Baumont R. (Éd). INRA Prod. Anim., 32, 323-338. @https://doi.org/10.20870/productions-animales.2019.32.2.2591
Peyraud J.L., Mc Leod M., 2021. Study on Future of EU livestock: how to contribute to a sustainable agricultural sector? European Commission, Directorate-General for Agriculture and Rural Development Unit C2 and Unit C4. B-1049 Brussels, 72 p. @https://op.europa.eu/en/publication-detail/-/publication/b10852e8-0c33-11eb-bc07-01aa75ed71a1
Peyraud J.L., (Coordinateur), O’Mara F., Granados Chapate A., Santos A.S., Journeaux L., Bee G., 2024. A Vision Paper for a sustainable Livestock sector in Europe: Challenges, ways of progress and suggested priorities for research for Horizon Europe to enhance innovation and sustainability in the livestock production sector of Europe’s food supply chains European. 22p. @http://animaltaskforce.eu/Portals/0/ATF/2024/ATF_Vision%20Paper_2024.pdf
Peyraud J.L. (coordinateur), O’Mara F., Granados Chapate A., Santos A.S., Journeaux L., Bee G., 2024. A strategic research and innovation agenda for a sustainable livestock sector in Europe. Challenges, ways of progress and suggested priorities for research for Horizon Europe to enhance innovation and sustainability in the livestock production sector of Europe’s food supply chains. Fourth White paper of the Animal Task Force. 70
Exposés
Peyraud J.L., 2021. Réduire les émissions de GES des troupeaux de ruminants. Session de l‘Académie d’Agriculture « contribution de l’agriculture à la réduction des GES pour atteindre la neutralité C en 2050 », 7 juin 2021, webinar.
@https://www.academie-agriculture.fr/actualites/academie/seance/academie/contribution-de-lagriculture-la-reduction-des-ges-pour-atteindre

Quelle conciliation entre producteurs, citoyens et consommateurs ?, Philippe Chemineau, Jean-Louis Peyraud, Michel Rieu, coordinateurs et Pascale Magdelaine, Michel Duru, Claude Vermot-Desroches, Claude Allo, Jacques Brulhet, Jean-Yves Le Déaut , Avril 2025.

Recevoir trois personnes-clé de Secure-IC dans l’émission Voyages extraordinaires dans le monde des sciences de Radio Laser, une émission créée en partenariat avec la plate-forme culturelle Unidivers, est plus qu’un événement ! Sylvain Guilley (directeur général et directeur technique), Jean Ginestière (directeur produit) et Patrick Lejoly (chef de produit) prennent tour-à-tour la parole pour nous embarquer dans leur aventure entreprenariale et sur bien d’autres sujets encore, comme leurs métiers et leurs rôles dans l’animation d’écosystèmes.
Une chance donc pour l’émission Voyages de discuter avec eux de leur vision sur la cybersécurité dans un monde où de plus en plus d’objets sont connectés et concernent toutes nos activités. La protection de ces objets, des infrastructures qui les relient, ainsi que des données qu’ils génèrent ou traitent, transportent et conservent – représente un enjeu essentiel y compris de souveraineté. Mais c’est une belle opportunité aussi de comprendre comment cette aventure a pu démarrer. Comment se sont-ils rencontrés ? Quelles ont été leurs motivations pour se lancer dans un tel projet.
Nous avons d’abord voulu tout savoir sur Secure-IC. Elle est peut-être née comme d’autres entreprises de haute technologie (deep tech) dans un garage mais elle s’affirme 15 ans après comme une réussite. Sa prouesse est en effet aujourd’hui d’être leader mondial dans son créneau. Déployée sur tous les continents mais solidement enracinée à Rennes en Bretagne, elle a bénéficié à sa création de soutiens bienveillants et en particulier de l’Institut Mines-Télécom à Paris comme à Rennes où elle fait partie de ces pépites dont la Bretagne est fière. Aujourd’hui, Secure-IC s’engage comme membre du Pôle d’Excellence Cyber (PEC) et coordinateur du groupe de travail de l’association Embedded France. Egalement, Secure-IC édite des standards internationaux, auprès de l’ISO, dans le domaine de la cryptographie et de la sécurité de l’information.
Mais ce n’est pas tout. Deux autres sujets nous tenaient à cœur. La sortie en librairie de leur livre « Comprendre la cybersécurité », un livre de la collection Espace des sciences aux éditions Apogée. Il est rare en effet de voir des dirigeants d’entreprises, souvent sous la pression du quotidien et des urgences de toutes sortes, se lancer dans un livre tourné vers les jeunes et le grand public. C’est la volonté d’ouverture vers la société civile, de partage de connaissances qui, à travers cet effort, traduit cette constance chez Sylvain, Jean et Patrick, de parler à la société au sens le plus large. Au-delà des aspects techniques compréhensibles par tous, le livre attire l’attention sur la responsabilité des utilisateurs, acteurs de la protection de leurs propres objets et données, propose les bonnes pratiques à mettre en œuvre. L’objectif est aussi de voir naître de nouvelles vocations pour ce champ en pleine expansion.
Les auteurs tiennent à remercier en particulier Isabelle Vizy de Csalakös et Cassandra Cadieu pour une assistance précieuse dans la pédagogie du texte et la production d’illustrations graphiques originales.
Ajoutons enfin que nous ne pouvions pas oublier l’événement à venir : la European Cyber Week qui aura lieu à Rennes du 17 au 20 novembre au couvent des Jacobins. Un forum dans sa dixième année qui s’inscrit dans la volonté d’inscrire Rennes et la Bretagne comme un élément clé de la politique cybersécurité de la France. Pour celles et ceux qui s’intéressent à la Cyber, n’hésitez pas à vous y rendre car nombre de séances sont publiques.
Jean Louis Coatrieux

À découvrir
https://www.secure-ic.fr/
https://www.secure-ic.com/
À lire
https://www.editions-apogee.com/73-espace-des-sciences
https://www.european-cyber-week.eu/fr
https://www.embedded-france.org/groupe-de-travail-cybersecurite-embarquee/
https://www.secure-ic.com/resources/standards-certification/
À voir et écouter
https://www.tvr.bzh/replay/57b9b75-tvr-info-13-10-2025

Nous recevons en ce mois d’octobre dans notre émission Voyages extraordinaires dans le monde des sciences, Marie Ruellan, maîtresse de conférences à Centrale-Supélec Rennes et chercheuse à l’institut d’Electronique et des Technologies du Numérique de l’Université de Rennes.
Les travaux de recherche de Marie Ruellan portent sur un enjeu qui nous concernent tous, dans notre vie de tous les jours. Il faut savoir en effet qu’en France, environ 40 % de la consommation d'énergie primaire et 20 % des émissions de gaz à effet de serre proviennent du bâtiment. Il s’agit donc d’un élément central pour toute politique visant à une neutralité carbone à moyen terme. Une réduction significative de la consommation d’énergie représente un sujet complexe car nombre de facteurs interviennent. Les plus évidents sont bien entendu la rénovation comme l’isolation de l’ancien et la construction du neuf (avec l’application de nouvelles normes, plus exigeantes).

Sur ce plan, si de nouveaux matériaux plus performants et plus écologiques, des méthodes de simulation physique capables de tenir compte au mieux de l’environnement et des évolutions saisonnières comme de celles liées au changement climatique, font partie des moyens à la disposition de la recherche, ils ne suffisent pas. Nous sommes nous aussi et autant impliqués par nos pratiques, par nos comportements. Les fameuses « heures creuses » donnent un exemple simple de mesures d’adaptation de notre consommation auxquelles il faut ajouter la prise en compte des variations de production d’énergie comme celles liées aux éoliennes ou d’autres. De plus, les situations d’habitat sont extrêmement variées (collectifs, pavillons, bureaux, magasins, usines…) y compris dans la composition des ménages et plus largement des activités.

Que savons-nous exactement, à la fois localement et globalement, du parc de bâtiments et d’habitations en France ? Pouvons-nous les classer en potentiel de gain énergétique ? Quelle part pour le chauffage, la ventilation et la climatisation ? Est-il possible de quantifier à l’échelle d’un parc de logements le potentiel d’économie en énergie ? Trouver au niveau des familles un équilibre entre confort, coût, et définir des stratégies de pilotage ? Par quelles méthodes ? Nous sommes donc, nous le voyons là, au cœur du sujet. Cet entretien avec Marie Ruellan va nous permettre d’établir un état de ce que nous savons aujourd’hui mais aussi de découvrir quelles sont les méthodes et les techniques dont nous disposons pour apporter des réponses à ces questions.
Les travaux de Marie Ruellan et de ses collègues sont exemplaires par leur pluridisciplinarité associant, thermiciens, automaticiens, mathématiciens, etc. mais aussi économistes, ergonomes, sociologues, juristes, ... et au-delà encore un tissu d’associations et d’actions participatives dont elle nous explique les rôles et l’importance. Incidemment, vous apprendrez avec elle à parler de nudge, un terme que Félix et moi avons découvert lors de cet entretien. Ecoutez-la pour en savoir plus !
Jean Louis Coatrieux et Félix Boulé
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Des colloques autour de ces sujets sont organisés régulièrement et ils sont ouverts au grand public ! Rendez-vous sur les sites correspondant aux deux journées organisées en 2024 et 2025 « Transition énergétique dans les territoires » :
https://www.ietr.fr/TerEner_2024_06_04_1erWorkshop
https://www.ietr.fr/TerEner_2025_06_27_2emeWorkshop
N’hésitez pas venir au prochain rendez-vous en 2026 ! Il sera annoncé sur Radio Laser et Unidivers !